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作詞家、アレンジャーらの男女4人組ユニット、ガーネット・クロウのメジャー・デビュー・シングル、2枚同時発売のうちの1枚（もう1枚は「君の家に着くまでずっと走ってゆく」）。日本テレビ系アニメ『名探偵コナン』オープニングテーマ。 1. Mysterious Eyes
2. Timing
3. Mysterious Eyes(Instrumental)
プロデュース：KANONJI（長戸大幸）
2000年3月29日に発売された。作詞はAZUKI七、作曲は中村由利、編曲は古井弘人。
シングル「君の家に着くまでずっと走ってゆく」との同時発売でのメジャーデビューということで各方面から話題を集めた。「君の家に着くまでずっと走ってゆく」や、3rdシングルとなった「二人のロケット」は、インディーズアルバム『first kaleidscope 〜君の家に着くまでずっと走ってゆく〜』にも収録されていた（「君の家に着くまでずっと走ってゆく」はアレンジが異なる）が、「Mysterious Eyes」は完全オリジナルの楽曲である。
メジャーデビュー前から、アニメ『名探偵コナン』にタイアップがつくなど話題になり、オリコンチャート内に10週以上もチャートインするロングヒットとなった。シングルの売上では、10枚目のシングル『夢みたあとで』に次いで2位となっている。尚、『名探偵コナン』のタイアップに起用されている8曲中、オープニングテーマに起用された曲は、この「Mysterious Eyes」と「涙のイエスタデー」「As the Dew」「Misty Mystery」の4曲である。
初回プレス盤には『名探偵コナン』カードゲームのオリジナルカードが封入されている。 『名探偵コナン』のオープニングの冒頭では歌手名がガーネットクロウとカタカナ表記になっていた。
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